1. Pulau Adal
2. Pulau Ampak-Ampak
3. Pulau Bai
4. Pulau Baik (Lahad Datu)
5. Pulau Bait
6. Pulau Bakau-Bakau
7. Pulau Bakubang
8. Pulau Bakungan
9. Pulau Bakungan Kecil
10. Pulau Balak
11. Pulau Balambangan
12. Pulau Balangkasan
13. Pulau Balundangan Besar
14. Pulau Balungangan Kecil
15. Pulau Balusuan
16. Pulau Bangan-Bangan
17. Pulau Banggi
18. Pulau Bankawan
19. Pulau Bangkuruan
20. Pulau Batawan
21. Pulau Batik
22. Pulau Batik Kulambu
23. Pulau Batu Laya-Laya
24. Pulau Berhala
25. Pulau Bilangan
26. Pulau Billean
27. Pulau Bingkulan
28. Pulau Bisa
29. Pulau Bodgaya
30. Pulau Bohayan (Lahad Datu)
31. Pulau Boheydulang
32. Pulau Bonting
33. Pulau Bum Bum
34. Pulau Bush
35. Pulau Buwaning
36. Pulau Daisy
37. Pulau Danawan
38. Pulau Daunan
39. Pulau Delconte
40. Pulau Dewa
41. Pulau Dinawan
42. Pulau Di Tg. Batai
43. Pulau Di Tg. Pendaras
44. Pulau Engot
45. Pulau Evans (Lahad Datu)
46 Pulau Gaya (Kota Kinabalu)
47. Pulau Gaya (Semporna)
48. Pulau Gatahan
49. Pulau Guhuan Utara
50. Pulau Gulisan
51. Pulau Gusong
52. Pulau Gusungan
53. Pulau Hutan Rimba
54. Pulau Jambongan
55. Pulau Kabili
56. Pulau Kahamkamman
57. Pulau Kalampunian
58. Pulau Kalampunian Besar
59. Pulau Kalampunian Damit
60. Pulau Kalangaan
61. Pulau Kalapuan
62. Pulau Kalumpang
63. Pulau Kalungan (Lahad Datu)
64. Pulau Kalung Kalungan
65. Pulau Kanawi
66. Pulau Kaniogan
67. Pulau Kapalai
68. Pulau Kawan
69. Pulau Kelautan
70. Pulau Keremat
71. Pulau Kukuban
72. Pulau Laila (Lahad Datu)
73. Pulau Lakatan
74. Pulau Landayang
75. Pulau Langkayan
76. Pulau Langgaan
77. Pulau Lambidan
78. Pulau Larapan
79. Pulau Latoan
80. Pulau Leonan
81. Pulau Libaran
82. Pulau Ligitan
83. Pulau Lihak-Lihak
84. Pulau Lihiman
85. Pulau Limau Limauan
86. Pulau Linkabo
87. Pulau Lungisan
88. Pulau Lungisan Kecil
89. Pulau Lubukan
90. Pulau Mabahok
91. Pulau Mabul
92. Pulau Maganting (Lahad Datu)
93. Pulau Maiga
94. Pulau Majinkil
95. Pulau Malawali
96. Pulau Maliangin Besar
97. Pulau Maliangin Kecil
98. Pulau Malundangan
99. Pulau Mamutik
100. Pulau Mandag-Mandag
101. Pulau Mandidarah
102. Pulau Mangkalai Darat
103. Pulau Mangkalai Laut
104. Pulau Mantabuan
105. Pulau Mantanani
106. Pulau Manukan
107. Pulau Mataking
108. Pulau Mataking Kecil
109. Pulau Mata Pahi
110. Pulau Mati
111. Pulau Menampilek
112. Pulau Mengalum
113. Pulau Merigi
114. Pulau Modom
115. Pulau Montokud
116. Pulau Musa
117. Pulau Nunuyan Darat
118. Pulau Nunuyan Laut
119. Pulau Nusa Kuyu
120. Pulau Nusa Tengah
121. Pulau Omadal
122. Pulau Pababag
123. Pulau Pagassan
124. Pulau Pakil
125. Pulau Palak
126. Pulau Pandan-Pandan
127. Pulau Pandanan
128. Pulau Pandawan
129. Pulau Panimbawan
130. Pulau Panukaran
131. Pulau Papahan
132. Pulau Pasir
133. Pulau Patanunam
134. Pulau Peduk
135. Pulau Pelana (Lahad Datu)
136. Pulau Penampangan
137. Pulau Plompong
138. Pulau Pom Pom
139. Pulau Puno Puno
140. Pulau Puru Puru
141. Pulau Sabangkat
142. Pulau Saddle
143. Pulau Saga
144. Pulau Sakar (Lahad Datu)
145. Pulau Salakan
146. Pulau Sandy
147. Pulau Sangai
148. Pulau Sapi
149. Pulau Saranga (Lahad Datu)
150. Pulau Sarangga
151. Pulau Sibangkat
152. Pulau Sebatik
153. Pulau Sedam
154. Pulau Selangan
155. Pulau Selingan
156. Pulau Sepanggar
157. Pulau Si Amil
158. Pulau Sibuon
159. Pulau Sikarindingan
160. Pulau Silawa
161. Pulau Silogong
162. Pulau Silumpat (Lahad Datu)
163. Pulau Silungun
164. Pulau Simandalan
165. Pulau Simial
166. Pulau Sinamgil
167. Pulau Sinjataan
168. Pulau Sipadan
169. Pulau Sipanggau
170. Pulau Sipindung
171. Pulau Sisipan
172. Pulau Straggler
173. Pulau Sulug
174. Pulau Sulok
175. Pulau Sungor
176. Pulau Tabawan (Lahad Datu)
177. Pulau Tabilian
178. Pulau Tabun
179. Pulau Tagabua
180. Pulau Tagujawan
181. Pulau Tambisan (Lahad Datu)
182. Pulau Tambulian
183. Pulau Tanah
184. Pulau Tongo
185. Pulau Tanjung
186. Pulau Tanjung Tiga Papan
187. Pulau Tatagan-Tatagan
188. Pulau Tegipil
189. Pulau Tetagan
190. Pulau Torongohok
191. Pulau Terumbu Eberett
192. Pulau Tetabuan
193. Pulau Tibakan
194. Pulau Tiga
195. Pulau Tigabu
196. Pulau Tigowis
197. Pulau Tikus
198. Pulau Timba Timba
199. Pulau Timbang
200. Pulau Timbun Mata
201. Pulau Timur
202. Pulau Tiong Kecil
203. Pulau Tree Rock
204. Pulau Udar Kecil
205. Pulau Udar Besar
206. Pulau Usukan
WILAYAH PERSEKUTUAN LABUAN
207. Pulau Burong
208. Pulau Daat
209. Pulau Kuraman
210. Pulau Labuan
211. Pulau Papan
212. Pulau Rusukan Besar
213. Pulau Rusukan Kecil
Sebenar tidak semua pulau tersenarai di sini terdapat pulau yang tidak memiliki nama (contohnya di Teluk Darvel, Teluk Tawau, Teluk Sandakan, Kepulauan di persisiran Beluran dan Muara Delta Sungai Kinabatangan) dan mungkin ada yang saya lupa..